Funkcia samočistenia (SELF-CLEAN) mení polaritu elektródy vo vami zvolenom intervale. Počas funkcie samočistenia elektródy sa chlór naďalej vytvára. Ak dôjde k výpadku napájania, solinátor si zapamätá posledné nastavenie (polaritu), ako aj čas, kedy bol v prevádzke, a po obnovení napájania program samočistenia (zmena polarity) pokračuje v už načatom cykle.